| # | Title | Length |
|---|
| 1 | 出たなツインビー（タイトルデモ） | 0:26 |
| 2 | メル女王からのメッセージ（スタートデモ） | 0:47 |
| 3 | 風の贈り物（ステージ1BGM） | 2:30 |
| 4 | イーバ星人の攻撃（ステージ1、2、5、6ボスBGM） | 1:26 |
| 5 | ありがとう！ツインビー（ステージクリアー） | 0:07 |
| 6 | 雲海を越えて（ステージ2BGM） | 2:11 |
| 7 | 天空の要塞ラピュタ（ステージ3BGM） | 1:39 |
| 8 | 来るなら来いっ（ステージ3、4ボスBGM） | 1:02 |
| 9 | World of the Mold（ステージ4BGM） | 1:13 |
| 10 | 水上の行進（ステージ5BGM） | 1:41 |
| 11 | イーバの神殿（ステージ6BGM） | 1:56 |
| 12 | 霧の向こうのパラダイス（ステージ7BGM） | 1:36 |
| 13 | イーバの帝王脳味噌昆虫（最終ボスBGM） | 1:13 |
| 14 | 惑星メルに平和の戻る日（エンディング） | 1:26 |
| 15 | Let's try again（ゲームオーバー） | 0:08 |
| 16 | Congratulations!（ランキング） | 0:32 |
| 17 | ポップンツインビー（タイトル） | 0:44 |
| 18 | マドカSOS!!（タイトルデモ） | 1:40 |
| 19 | えらんじゃお（ネームエントリー） | 0:29 |
| 20 | 風に誘われて（Twin memories）（ステージ1BGM） | 1:52 |
| 21 | ぶっとび大砲野郎どもに捧ぐ（ステージ1、5、6ボスBGM） | 1:10 |
| 22 | やったね！Part2（アイキャッチ2） | 0:09 |
| 23 | 海底のお散歩（ステージ2BGM） | 1:33 |
| 24 | メカボス野郎のテーマ（ステージ2、3、4ボスBGM） | 1:27 |
| 25 | やったね！Part1（アイキャッチ1） | 0:16 |
| 26 | 虹色の風（ステージ3BGM） | 2:11 |
| 27 | 勇気ある前進（ステージ4BGM） | 1:43 |
| 28 | Sky Avenue（ステージ5BGM） | 1:53 |
| 29 | 熱いぞ！マグマベース（ステージ6BGM） | 2:16 |
| 30 | 最後だ！行ってみよう（ステージ7BGM） | 1:52 |
| 31 | おじいちゃんの最終兵器だ（最終ボスBGM） | 1:03 |
| 32 | Eternal Planets（エンディング） | 1:38 |
| 33 | 負けないもん（コンティニュー） | 0:38 |
| 34 | しゅーん（ゲームオーバー） | 0:09 |
| 35 | がんばったね！（ハイスコア） | 0:39 |
| 36 | 失われたメロディ（オープニングデモ） | 0:31 |
| 37 | 僕らのステキ 〜ヤッホー！バージョン〜（タイトルデモ） | 1:27 |
| 38 | レッツ・チャレンジ！（難易度セレクトBGM） | 0:47 |
| 39 | 油断しないでねっ！（装備セレクトBGM） | 0:42 |
| 40 | Twin Flight（ステージ1BGM 〜SISILIA ISLE〜） | 1:49 |
| 41 | Kiss my Parasol（ステージ1ボスBGM） | 1:36 |
| 42 | 僕らのステキ 〜ヤッホー！クリアーバージョン〜（ステージクリアー） | 0:09 |
| 43 | Sky Swimming（ステージ2BGM 〜RUINS〜） | 2:08 |
| 44 | ラブラブ・ファンファン・タイフーン（ステージ2ボスBGM） | 1:15 |
| 45 | 海のかなたへ（ステージ3BGM 〜OVER THE SEA〜） | 1:49 |
| 46 | クレイジー・テルピッツ（ステージ3ボスBGM） | 1:26 |
| 47 | 空中回廊（ステージ4BGM 〜AERIAL CORRIDOR〜） | 2:03 |
| 48 | バルル〜ンのマーチ（ステージ4ボスBGM） | 1:11 |
| 49 | Dancing Toys（ステージ5BGM 〜WONDER PALACE〜） | 1:51 |
| 50 | Wonderful Armor（ワンダー・ワンダフルBGM） | 1:06 |
| 51 | ナンセンス大公の陰謀（エレキドール・エミリー登場BGM） | 0:33 |
| 52 | Schizoid Doll（エレキドール・エミリーBGM | 1:20 |
| 53 | 君に会うために．．．（ステージ6BGM 〜THE CHASE〜） | 1:57 |
| 54 | 僕らのステキ 〜ヤッホー！インストバージョン〜（エンディング） | 2:01 |
| 55 | すっごーい！（ランキング） | 0:48 |
| 56 | きっとまた会えるよねっ！（ゲームオーバー） | 0:10 |
| 57 | Magical Melody（未使用 スタッフロールBGM） | 2:25 |
